公积金贷款如果逾期，那的确会影响以后办理商业贷款，因为在办理贷款的时候，银行势必会通过审查客户的征信报告来了解其信用状况。而公积金贷款逾期是会记录在征信里的，一旦被审查发现征信里有逾期不良记录，银行自然会因为担心放贷风险较大而拒绝批贷。
别说是商业贷款了，后续去任何一家银行或其他金融机构办理信贷业务都将受到阻碍，短时间内基本办不下来。客户只能赶紧还清欠款，然后花时间好好修复受损的信用，等何时信用养好了，届时才有机会贷到款。
因此，建议客户平时都养成按时还款的良好习惯，尽量避免出现逾期情况。若是已经逾期了，也得想办法尽快还清，好将不良影响降到最低。不逾期记录一直保留在征信时，个人信用修复不了，之后都别想贷款了。
公积金贷款买房和商业贷款买房的区别
1、房屋的类型不同
住房公积金贷款只能用于购买70年产权的住宅时使用，除此之外的商住等类型的房屋是不能申请公积金贷款的;商业贷款面对的房屋类型较为宽松，除了住宅之外，商住两用房也可以申请。
2、贷款额度和利率不同
住房公积金贷款的利率按照规定是实行一年一定，在贷款期间如遇到利率调整，如果贷款期限只有一年，则这个利率就不做调整。如果贷款的期间是在一年以上，则从下一年的一月一日执行新的利率，额度则根据当地情况为标准。商业贷款的利率则根据当地银行而定，一般无上限，具体则根据家庭总收入而定。虽然公积金贷款利率一年一定，但利率还是比商业贷款低很多。
3、贷款年限不同
公积金贷款要求总贷款年限不超过三十年(各地略不同)，而商业贷款期限则比较灵活，可供还款的期限也更长。
4、审批时间和机构不同
商业贷款大约20个工作日，公积金贷款大约需要40个工作日，商业贷款快于公积金贷款。商业房贷主要通过银行审批，决定权在银行;公积金房贷则需要通过公积金管理核心审批，决定权在公积金管理核心，银行只是执行机构。
5、要求不同
商业贷款的要求是个人信用良好，没有不良征信记录，具备还款能力。公积金贷款要求比较严格，除了要求个人的信用良好，还有要求自贷款之日起的6个月(各地略不同)内个人的公积金账户须是连续正常且足额缴纳的。
6、贷款来源不同
商业贷款来源于银行等放贷机构筹集的社会公众资金，而公积金房屋贷款来源于职工个人及所在单位缴存的住房公积金。
